A Beitar Jerusalem - AS Saint-Étienne 1:2 (1:2)
R AS Saint-Étienne - Beitar Jerusalem 0:0 (0:0)
A: 17.08.2016 18:00 R: 25.08.2016 20:45 Vincitore: AS Saint-Étienne
A FK Astana - BATE Borisov 2:0 (0:0)
R BATE Borisov - FK Astana 2:2 (1:0)
A: 18.08.2016 16:00 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: FK Astana
A Dinamo Tbilisi - PAOK Saloniki 0:3 (0:1)
R PAOK Saloniki - Dinamo Tbilisi 2:0 (2:0)
A: 18.08.2016 18:00 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: PAOK Saloniki
A SønderjyskE - Sparta Praga 0:0 (0:0)
R Sparta Praga - SønderjyskE 3:2 (1:2)
A: 18.08.2016 18:15 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: Sparta Praga
A FC Midtjylland - Osmanlıspor FK 0:1 (0:1)
R Osmanlıspor FK - FC Midtjylland 2:0 (1:0)
A: 18.08.2016 18:30 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: Osmanlıspor FK
A FK Krasnodar - FK Partizani 4:0 (3:0)
R FK Partizani - FK Krasnodar 0:0 (0:0)
A: 18.08.2016 18:30 R: 25.08.2016 19:30 Vincitore: FK Krasnodar
A AEK Larnaca - Slovan Liberec 0:1 (0:1)
R Slovan Liberec - AEK Larnaca 3:0 (3:0)
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 19:00 Vincitore: Slovan Liberec
A Austria Wien - Rosenborg BK 2:1 (0:0)
R Rosenborg BK - Austria Wien 1:2 (0:0)
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 19:00 Vincitore: Austria Wien
A Gabala FK - NK Maribor 3:1 (1:1)
R NK Maribor - Gabala FK 1:0 (0:0)
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 20:15 Vincitore: Gabala FK
A Slavia Praha - RSC Anderlecht 0:3 (0:0)
R RSC Anderlecht - Slavia Praha 3:0 (2:0)
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: RSC Anderlecht
A IFK Göteborg - Qarabağ FK 1:0 (0:0)
R Qarabağ FK - IFK Göteborg 3:0 (2:0)
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 18:30 Vincitore: Qarabağ FK
A Maccabi Tel Aviv - Hajduk Split 2:1 (1:0)
R Hajduk Split - Maccabi Tel Aviv 3:4 (1:0, 2:1, 2:1) dr
A: 18.08.2016 19:00 R: 25.08.2016 20:30 Vincitore: Maccabi Tel Aviv
A İstanbul Başakşehir - Shakhtar Donetsk 1:2 (0:2)
R Shakhtar Donetsk - İstanbul Başakşehir 2:0 (1:0)
A: 18.08.2016 19:30 R: 25.08.2016 21:00 Vincitore: Shakhtar Donetsk
A Lokomotiva Zagreb - KRC Genk 2:2 (0:1)
R KRC Genk - Lokomotiva Zagreb 2:0 (1:0)
A: 18.08.2016 20:00 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: KRC Genk
A Vojvodina - AZ Alkmaar 0:3 (0:2)
R AZ Alkmaar - Vojvodina 0:0 (0:0)
A: 18.08.2016 20:00 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: AZ Alkmaar
A Fenerbahçe - Grasshopper Club Zürich 3:0 (1:0)
R Grasshopper Club Zürich - Fenerbahçe 0:2 (0:0)
A: 18.08.2016 20:00 R: 25.08.2016 19:00 Vincitore: Fenerbahçe
A Panathinaikos - Brøndby IF 3:0 (1:0)
R Brøndby IF - Panathinaikos 1:1 (1:0)
A: 18.08.2016 20:00 R: 25.08.2016 19:00 Vincitore: Panathinaikos
A Astra Giurgiu - West Ham United 1:1 (0:1)
R West Ham United - Astra Giurgiu 0:1 (0:1)
A: 18.08.2016 20:15 R: 25.08.2016 20:45 Vincitore: Astra Giurgiu
A KAA Gent - KF Shkëndija 79 2:1 (1:1)
R KF Shkëndija 79 - KAA Gent 0:4 (0:0)
A: 18.08.2016 20:30 R: 25.08.2016 20:00 Vincitore: KAA Gent
A Sassuolo - Crvena Zvezda 3:0 (2:0)
R Crvena Zvezda - Sassuolo 1:1 (0:1)
A: 18.08.2016 20:45 R: 25.08.2016 20:30 Vincitore: Sassuolo
A FC Arouca - Olympiakos Piräus 0:1 (0:1)
R Olympiakos Piräus - FC Arouca 2:1 (0:0, 0:1) dts
A: 18.08.2016 21:00 R: 25.08.2016 20:45 Vincitore: Olympiakos Piräus
A FK AS Trenčín - Rapid Wien 0:4 (0:1)
R Rapid Wien - FK AS Trenčín 0:2 (0:2)
A: 18.08.2016 21:05 R: 25.08.2016 21:05 Vincitore: Rapid Wien