A Austria Wien - SL Benfica 1:1 (1:1)
R SL Benfica - Austria Wien 3:0 (2:0)
A: 08.08.2006 20:45 R: 22.08.2006 21:15 Vincitore: SL Benfica
A Dinamo Zagabria - Arsenal FC 0:3 (0:0)
R Arsenal FC - Dinamo Zagabria 2:1 (0:1)
A: 08.08.2006 21:05 R: 23.08.2006 21:05 Vincitore: Arsenal FC
A CSKA Mosca - MFK Ružomberok 3:0 (0:0)
R MFK Ružomberok - CSKA Mosca 0:2 (0:2)
A: 09.08.2006 18:00 R: 23.08.2006 20:00 Vincitore: CSKA Mosca
A Dinamo Kiev - Fenerbahçe 3:1 (1:0)
R Fenerbahçe - Dinamo Kiev 2:2 (1:2)
A: 09.08.2006 18:00 R: 23.08.2006 20:00 Vincitore: Dinamo Kiev
A Lille OSC - FK Rabotnički 3:0 (0:0)
R FK Rabotnički - Lille OSC 0:1 (0:1)
A: 09.08.2006 18:00 R: 23.08.2006 20:00 Vincitore: Lille OSC
A Shakhtar Donetsk - Legia Warszawa 1:0 (1:0)
R Legia Warszawa - Shakhtar Donetsk 2:3 (1:3)
A: 09.08.2006 18:30 R: 23.08.2006 20:30 Vincitore: Shakhtar Donetsk
A Levski Sofia - Chievo Verona 2:0 (1:0)
R Chievo Verona - Levski Sofia 2:2 (0:1)
A: 09.08.2006 19:30 R: 23.08.2006 21:00 Vincitore: Levski Sofia
A Galatasaray - FK Mladá Boleslav 5:2 (2:0)
R FK Mladá Boleslav - Galatasaray 1:1 (0:0)
A: 09.08.2006 19:30 R: 23.08.2006 19:30 Vincitore: Galatasaray
A Slovan Liberec - Spartak Moskva 0:0 (0:0)
R Spartak Moskva - Slovan Liberec 2:1 (1:0)
A: 09.08.2006 20:15 R: 23.08.2006 17:00 Vincitore: Spartak Moskva
A Standard Liège - Steaua Bucureşti 2:2 (1:1)
R Steaua Bucureşti - Standard Liège 2:1 (1:1)
A: 09.08.2006 20:30 R: 23.08.2006 19:30 Vincitore: Steaua Bucureşti
A FC Copenaghen - AFC Ajax 1:2 (0:1)
R AFC Ajax - FC Copenaghen 0:2 (0:0)
A: 09.08.2006 20:30 R: 23.08.2006 20:30 Vincitore: FC Copenaghen
A Amburgo - CA Osasuna 0:0 (0:0)
R CA Osasuna - Amburgo 1:1 (1:0)
A: 09.08.2006 20:30 R: 22.08.2006 20:45 Vincitore: Amburgo
A RB Salzburg - Valencia CF 1:0 (0:0)
R Valencia CF - RB Salzburg 3:0 (2:0)
A: 09.08.2006 20:45 R: 22.08.2006 22:00 Vincitore: Valencia CF
A Heart of Midlothian - AEK Athen 1:2 (0:0)
R AEK Athen - Heart of Midlothian 3:0 (0:0)
A: 09.08.2006 20:45 R: 23.08.2006 20:45 Vincitore: AEK Athen
A Milan - Crvena Zvezda 1:0 (1:0)
R Crvena Zvezda - Milan 1:2 (0:1)
A: 09.08.2006 20:45 R: 22.08.2006 21:00 Vincitore: Milan
A Liverpool FC - Maccabi Haifa 2:1 (1:1)
R Maccabi Haifa - Liverpool FC 1:1 (0:0)
A: 09.08.2006 21:05 R: 22.08.2006 20:35 Vincitore: Liverpool FC